Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PIK3CBP42338 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms