Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD1P33897 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ABCD1P33897 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms