Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA10P31260 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms