Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GTF2E2P29084 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms