Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms