Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRG2P13727 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRG2P13727 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRG2P13727 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms