Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POP4O95707 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POP4O95707 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POP4O95707 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POP4O95707 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms