Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
WISP3O95389 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms