Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG7O95352 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms