Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOL3O95236 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOL3O95236 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
APOL3O95236 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms