Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DKK1O94907 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK1O94907 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms