Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCO2O43819 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms