Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OIP5O43482 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OIP5O43482 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OIP5O43482 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OIP5O43482 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms