Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms