Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP17L12C9JPN9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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USP17L12C9JPN9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
USP17L12C9JPN9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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