Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
B4DGG1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms