Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TNFSF18Q9UNG2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNFSF18Q9UNG2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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