Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF346Q9UL40 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF346Q9UL40 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms