Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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RABGEF1Q9UJ41 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1Q9UJ41 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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