Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms