Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CMTM6Q9NX76 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms