Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ABCC13Q9NSE7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ABCC13Q9NSE7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms