Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms