Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms