Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOL6Q9BWW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOL6Q9BWW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms