Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MCMBPQ9BTE3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms