Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTKNQ9BST9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms