Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ECSITQ9BQ95 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms