Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GPA33Q99795 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GPA33Q99795 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms