Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PITX2Q99697 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms