Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPS6KC1Q96S38 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms