Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX18Q96RF0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms