Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HIC2Q96JB3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms