Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HERVK_113Q902F9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms