Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms