Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFRP1Q8N474 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFRP1Q8N474 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms