Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LTBP4Q8N2S1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBP4Q8N2S1 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms