Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSH2Q76I76 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSH2Q76I76 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms