Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC30A6Q6NXT4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms