Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PDZK1Q5T2W1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDZK1Q5T2W1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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