Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NTRK2Q16620 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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