Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ACKR1Q16570 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms