Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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