Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIP13Q15645 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms