Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAM2Q15035 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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