Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FRMPD4Q14CM0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms