Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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GBX1Q14549 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX1Q14549 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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