Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms