Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CBX3Q13185 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX3Q13185 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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