Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PRKAA1Q13131 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PRKAA1Q13131 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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